QUAN HỆ DI TRUYỀN DỰA TRÊN GENE CYTOCHROME B Ở HEO RỪNG VIỆT NAM TỈNH ĐẮK NÔNG
Tóm tắt
Nghiên cứu nhằm đánh giá mối quan hệ di truyền của heo rừng tỉnh Đắk Nông dựa trên trình tự gene cytochrome b. Kết quả sắp xếp trình tự cho thấy tồn tại 26 điểm đa hình đơn nucleotide (SNP) giữa các haplotype ở heo rừng Đắk Nông với các haplotype khác từ châu Á và châu Âu. Vùng biến đổi mạnh xuất hiện từ vị trí 15029 đến 15045. Haplotype DKN3 và nhóm heo rừng bản địa Việt Nam biểu hiện một vị trí các SNP giống hệt nhau là TATG; trong khi các haplotype DKN1, DKN4-DKN7 và nhóm heo rừng lai Việt Nam cùng biểu hiện hai vị trí SNP CATA và CATG. Các haplotype DKN1, DKN4-DKN7 và nhóm heo rừng lai Việt Nam có mối quan hệ di truyền chặt chẽ với lợn rừng châu Á; trong khi haplotype DKN3 và heo rừng bản địa Việt Nam nằm trong nhánh tách rời của cây phát sinh loài. Kết quả này cho thấy có hai quần thể heo rừng ở Đắk Nông, dẫn đến kết luận rằng heo rừng bản địa Việt Nam và heo rừng lai Việt Nam có sự phân bố trải rộng khắp Tây Nguyên.
Từ khóa
Toàn văn:
PDF (English)Trích dẫn
Amills, M., Megens, H. J., Manunza, A., Ramos-Onsins, S. E., & Groenen, M. A. (2018). A genomic perspective on Wild Boar Demography and Evolution. In: Meletti M, Meijaard E, editors. Ecology, Conservation and Management of Wild Pigs and Peccaries. Cambridge University Press, 376-387.
Clop, A., Amills, M., Noguera, J. L., Fernández, A., Capote, J., Ramón, M. M., Kelly, L., Kijas, J. M. H., Andersson, L., & Sànchez, A. (2004). Estimating the frequency of Asian cytochrome B haplotypes in standard European and local Spanish pig breeds. Genet Sel Evol, 36, 97.
Fernández, A. I., Alves, E., Fernández, A., de Pedro, E., López-García, M. A., Ovilo, C., Rodríguez, M. C., & Silió, L. (2008). Mitochondrial Genome Polymorphisms Associated with Longissimus Muscle Composition in Iberian Pigs. J Anim Sci, 86(6), 1283-1290.
Garcias, G., Vergara, J., & Lombardi, R. (2011). Genetic characterization and phylogeography of the wild boar Sus scrofa introduced into Uruguay. Genet Mol Biol, 34(2), 329-337.
Giuffra, E., Kijas, J. M., Amarger, V., Carlborg, O., Jeon, J. T., & Andersson, L. (2000). The Origin of the domestic pig: independent domestication and subsequent introgression. Genetics, 154(4), 1785-1791.
Groves, C. P., Schaller, G. B., Amato, G., & Khounboline, K. (1997). Rediscovery of the wild pig Sus bucculentus. Nature, 386, 335.
Ishiguro, N., Sasaki, M., Iwasa, M., Shigehara, N., Hongo, H., Anezaki, T., Long, V. T., Lan, D. T. B., & Long, P.T. (2008). mtDNA Variation in Vietnamese pigs, with particular emphasis on the genetic relationship between wild boars from Vietnam and the Ryukyu Islands. Mammal Study, 33(2), 51-68.
Jadav, K. K., Shrivastav, A. B., Rajput, N., & Joshi, H. R. (2014). Cytochrome b gene based phylogeny and genetic differentiation of Indian wild pig (Sus scrofa cristatus). Indian Res J Genet Biotechnol, 6(4), 605-612.
Jones, G. F. (1998). Genetic Aspects of Domestication, Common Breeds and Their Origin. In: Rothschild, M.F. and Ruvinsky, A., Eds., The genetics of the Pig, CAB International, Wallingford, 17-50.
Larson, G., Dobney, K., Albarella, U., Meiying, F., Matisoo-Smith, E., Robins, J., Lowden, S., Finlayson, H., Brand, T., Willerslev, E., Rowley-Conwy, P., Andersson, L., & Cooper, A. (2005). Worldwide phylogeography of Wild Boar Reveals Muliple Centers of pig domestication. Science, 307(5715), 1618-1621.
Lee, C. E. (2002). Evolutionary Genetics of Invasive Species. Trends Ecol Evol, 17(8), 386-391.
Le,.T. L., Nguyen, T. P. M., Doan, M. C., Do,. M. C., Ho, N. Q. C., & Hoang, N. S. (2014).
The genetic relationship of Vietnamese pigs in Central Highlands assessed by cytochrome b. Open J Genet, 4(5), 362-369.
Mona, S., Randi, E., & Ponzetta, M. T. (2007). Evolutionary history of the genus Sus inferred from cytochrome b sequences. Mol Phylogenet Evol, 45(2), 757-762
Niu, T., Yu, L., He, X., Zhao, S., & Xu, C. (2019). The complete mitochondrial genome of Min pig (Hebao) and a phylogenetic analysis. Mitochondrial DNA Part B, 4(2), 3657-3658.
Pradhan, M., Pal, A., Samanta, A. K., Banerjee, S., & Samanta, R. (2018). Mutations in cytochrome B gene effects female reproduction of Ghungroo pig. Theriogenology, 119, 121-130.
Saitou, N., & Nei, M. (1987). The Neighbor-Joining Method: A New Method for Reconstructing Phylogenetic Trees. Mol Biol Evol, 4(4), 406-425.
Scandura, M., Iacolina, L., & Apollonio, M. (2011). Genetic diversity in the European wild boar Sus scrofa: phylogeography, population structure and wild x domestic hybridization. Mammal Review, 41(2), 125-137.
Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M., & Kumar, S. (2011). MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Mol Biol Evol, 28(10), 2731-2739.
Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A., & Kumar, S. (2013). MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Molecular biology and evolution. 30. 10.1093/molbev/mst197.
Tsai, T. S., Rajasekar, S., & St. John, J. C. (2016). The relationship between mitochondrial DNA haplotype and the reproductive capacity of domestic pigs (Sus scrofa domesticus). BMC Genet, 17, 67.
Vilaca, S. T., Biosa, D., Zachos, F., Iacolina, L., Kirschning, J., Alves, P. C., Paule, L., Gortázar, C., Mamuris, Z., Jedrzejewska, B., et al. (2014). Mitochondrial phylogeography of the European wild boar: The effect of climate on genetic diversity and spatial lineage sorting across Europe. J Biogeogr, 41(5), 987-998.
Wu, G. S., Yao, Y. G., Qu, K. X., Ding, Z. L., Li, H., Palanichamy, M. G., Duan, Z. Y., Li, N., Chen, Y. S., & Zhang, Y. P. (2007). Population phylogenomic analysis of mitochondrial DNA in wild boars and domestic pigs revealed multiple domestication events in East Asia. Genome Biol, 8, R245.
DOI: https://doi.org/10.54607/hcmue.js.18.12.3273(2021)
Tình trạng
- Danh sách trống